Die Geschäftsprüfungskommission (GPK) der Katholischen Kirchgemeinde Region Rorschach hat die Aufgabe, die Geschäfte des Kirchenverwaltungsrates regelmässig zu prüfen. Sie tut dies mittels Einsicht in sämtliche Protokolle samt Beilagen des Kirchenverwaltungsrates. Damit werden die Anwendung der massgebenden Haushalts- und Verwaltungsvorschriften und der aktuellen Reglemente und Weisungen beurteilt. Bei der Prüfung der Amtsführung wird im Speziellen beurteilt, ob deren Gesetzeskonformität gegeben ist. Die GPK richtet aufgrund ihrer Prüfungen regelmässig Fragen an den KVR und ist mindestens einmal jährlich im Austausch mit dem Gesamtrat.

In der Rechnungsprüfung wird die GPK durch eine externe Revisionsgesellschaft unterstützt.